Escudo Atual
Desde 1999 o Santa Cruz carrega um novo símbolo no peito. Com um visual mais moderno e usando estrelas comemorativas o escudo foi redesenhado no mandanto do presidente Jonas Alvarenga.
As três estrelas de cima representam o Tri-Super Campeonato conquistado em 1957, 1976 e 1983, as cinco estrelas de baixo representam o Penta Campeonato Pernambucano conquistado nos anos de 1969, 1970, 1971, 1972 e 1973. Já o número 1914 ilustra o ano de fundação do Mais Querido.
Escudo Antigo
O escudo do Santa Cruz Futebol Clube foi criado no ano de 1915, logo após a fundação da instituição.
O autor do desenho foi um dos atletas que vestiam a camisa do Mais Querido na época, o atacante Teófilo B. de Carvalho, mais conhecido como Lacraia.
Escudo Comemorativo
No ano de 2004 foi lançado um escudo comemorativo aos noventa anos do Santa Cruz.
O símbolo remete ao passado e é inspirado nos primeiros desenhos registrados na sala de história do clube.